新京報(bào)訊(記者王卡拉)壁虎斷尾重生,蠑螈大腦自愈……我們常感嘆人類(lèi)為什么沒(méi)有這樣的“超能力”?其實(shí),在哺乳動(dòng)物中,像兔子、山羊等也具備一定的再生能力。而人類(lèi)、小鼠這類(lèi)高等哺乳動(dòng)物受傷后,往往只能結(jié)疤愈合,無(wú)法“原裝”再生。為什么高等哺乳動(dòng)物在進(jìn)化過(guò)程中丟失了這些能力?這是生物學(xué)界的一大謎題。
科學(xué)家們?cè)谛∈蠛屯米拥摹岸洹鄙险业搅岁P(guān)鍵線索。近日,北京華大生命科學(xué)研究院聯(lián)合北京生命科學(xué)研究所,基于華大自主研發(fā)的時(shí)空組學(xué)技術(shù)Stereo-seq和高通量測(cè)序平臺(tái)DNBSEQ-Tx系列,首次發(fā)現(xiàn)Aldh1a2基因的表達(dá)不足導(dǎo)致的視黃酸合成不足,是高等哺乳動(dòng)物小鼠耳廓再生失敗的核心機(jī)制。在激活該基因后,小鼠耳廓實(shí)現(xiàn)再生。這為深入理解進(jìn)化過(guò)程中哺乳動(dòng)物的再生能力丟失提供了新的見(jiàn)解,并為再生醫(yī)學(xué)和人類(lèi)受損器官的重建與再生提供了重要靶標(biāo)。
《科學(xué)》官網(wǎng)截圖
研究團(tuán)隊(duì)選取了哺乳動(dòng)物特有器官耳廓(外耳)為研究模型,基于單細(xì)胞RNA測(cè)序和華大自主研發(fā)的時(shí)空組學(xué)技術(shù)Stereo-seq,描繪了可再生物種(兔子)與不可再生物種(小鼠)耳廓損傷后再生/修復(fù)的高分辨率單細(xì)胞時(shí)空動(dòng)態(tài)過(guò)程,逐時(shí)逐步觀察傷口處每個(gè)細(xì)胞類(lèi)型的變化和基因表達(dá)動(dòng)態(tài),精確對(duì)比再生過(guò)程和普通愈合過(guò)程有何不同。
結(jié)果發(fā)現(xiàn),小鼠耳廓再生失敗與視黃酸合成不足有關(guān)。視黃酸是維生素A的一種代謝產(chǎn)物,與細(xì)胞發(fā)育密切相關(guān)。而小鼠視黃酸不足主要是因?yàn)橐朁S酸合成限速酶Aldh1a2的表達(dá)不足,以及視黃酸本身的降解加速。
為什么小鼠的Aldh1a2基因表達(dá)會(huì)不足呢?科研團(tuán)隊(duì)通過(guò)進(jìn)化生物學(xué)比較發(fā)現(xiàn),在兔子的基因組中,保留了負(fù)責(zé)調(diào)控Aldh1a2基因的一些關(guān)鍵DNA序列。這些調(diào)控序列被稱(chēng)為“增強(qiáng)子”,可以理解為基因表達(dá)的開(kāi)關(guān)或加速器。研究人員在兔子Aldh1a2基因附近發(fā)現(xiàn)了6個(gè)活躍的增強(qiáng)子(AE1-AE6),其中有兩個(gè)增強(qiáng)子(AE1和AE5)在耳廓受傷再生時(shí)會(huì)被強(qiáng)烈激活,相當(dāng)于在兔子受傷后及時(shí)按下“開(kāi)關(guān)”,大大提高了Aldh1a2的表達(dá),在兔子傷口處源源不斷地產(chǎn)生視黃酸,幫助組織再生。
可惜的是,研究團(tuán)隊(duì)僅在小鼠對(duì)應(yīng)的基因區(qū)域找到了1個(gè)活性增強(qiáng)子(AE3),其他與再生相關(guān)的調(diào)控元件都已失活。換句話說(shuō),小鼠體內(nèi)調(diào)控Aldh1a2基因的“按鈕”大都消失了,受傷后想要大幅度開(kāi)啟Aldh1a2基因表達(dá)非常困難。這一進(jìn)化差異解釋了為什么小鼠耳廓受傷后Aldh1a2“叫不醒”、視黃酸產(chǎn)量提不高,從而無(wú)法像兔子那樣再生組織。
如果人為按下這些丟失的“開(kāi)關(guān)”,是否就能讓失去再生能力的動(dòng)物實(shí)現(xiàn)再生呢?研究團(tuán)隊(duì)進(jìn)行了探索:他們嘗試直接激活A(yù)ldh1a2基因或外源補(bǔ)充視黃酸,發(fā)現(xiàn)都可以使本不具備再生能力的成年小鼠耳廓傷口,出現(xiàn)了多能性細(xì)胞(成纖維細(xì)胞),從而重建了耳廓的軟骨與神經(jīng)組織。也就是說(shuō),小鼠耳朵的傷口不再只是簡(jiǎn)單結(jié)疤,而是實(shí)現(xiàn)了再生。
此外,研究團(tuán)隊(duì)還將兔子的增強(qiáng)子AE1導(dǎo)入小鼠的基因組,結(jié)果發(fā)現(xiàn),受傷后的小鼠耳廓Aldh1a2基因表達(dá)顯著提高,視黃酸增加,耳廓的再生能力也得到明顯提升。
總而言之,研究團(tuán)隊(duì)基于單細(xì)胞時(shí)空組技術(shù)以及跨物種進(jìn)化比較,系統(tǒng)描繪了器官損傷后,可再生物種與不可再生物種的細(xì)胞組成變化以及基因表達(dá)的時(shí)空動(dòng)態(tài)變化,全面揭示了高等哺乳動(dòng)物器官再生能力丟失的機(jī)制,為探索人類(lèi)受損器官的重建與再生提供了重要靶標(biāo)和理論依據(jù)。
相關(guān)成果發(fā)表于國(guó)際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊《科學(xué)》(Science)。北京生命科學(xué)研究所林煒?shù)h博士研究生、賈小慧博士研究生,北京華大生命科學(xué)研究院副研究員石小峰,西北農(nóng)林科技大學(xué)副教授赫秋亞,北京華大生命科學(xué)研究院助理研究員張盼玉為論文共同第一作者。北京生命科學(xué)研究所研究員王偉、北京華大生命科學(xué)研究院研究員鄧子卿和西北農(nóng)林科技大學(xué)教授羅軍為論文共同通訊作者。該研究得到了國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目的資助,也獲得了北京生命科學(xué)研究所倫理審查委員會(huì)和華大科技倫理委員會(huì)的批準(zhǔn)。
校對(duì) 劉軍